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| タイトル | 発行年 | 発行 |
| 日本の希少な水生生物に関するデータブック（水産庁編） | １９９８ | 日本水産資源保護協会 |
| レッドデータブック2014 −日本の絶滅のおそれのある野生生物− 3 爬虫類・両生類 | ２０１５ | ぎょうせい |
| 改訂・日本の絶滅のおそれのある野生生物 −レッドデータブック−汽水・淡水魚類 |
２００３ | 自然環境研究センター |
| レッドデータブック2014 −日本の絶滅のおそれのある野生生物− 4 汽水・淡水魚類 | ２０１５ | ぎょうせい |
| 改訂・日本の絶滅のおそれのある野生生物 −レッドデータブック−陸・淡水産貝類 |
２００５ | 自然環境研究センター |
| レッドデータブック2014 −日本の絶滅のおそれのある野生生物− 6 貝類 | ２０１５ | ぎょうせい |
| 改訂・日本の絶滅のおそれのある野生生物 −レッドデータブック−クモ形類・甲殻類等 |
２００６ | 自然環境研究センター |
| レッドデータブック2014 −日本の絶滅のおそれのある野生生物− 7 その他無脊椎動物（クモ形類・甲殻類等） |
２０１５ | ぎょうせい |
| 茨城県版レッドデータブック 茨城における絶滅のおそれのある野生生物＜動物編＞ー普及版ー |
２００１ | 茨城県生活環境部 環境政策課 |
| レッドデータブックとちぎ 栃木県の保護上注目すべき地形・地質・野生動植物 |
２００５ | 栃木県環境森林部 自然環境課 |
| 群馬県の絶滅のおそれのある野生生物ハンドブック「動物編」 | ２００２ | 群馬県環境生活部 自然環境課 |
| 改訂 埼玉県レッドデータブック動物編 SAITAMA pref. red data book | ２００２ | 埼玉県 |
| 千葉県の保護上重要な野生生物 千葉県レッドデータブック−普及版− | ２００１ | 千葉県環境財団 |
| 東京都の保護上重要な野生生物種 −東京都レッドデータブック普及版− | １９９９ | 東京都 |
| まもりたい静岡県の野生生物 −県版レッドデータブック− 動物編 ２００４ |
２００４ | 羽衣出版 |
| まもりたい静岡県の野生生物 −県版レッドデータブック− ２００４ 【普及版】 | ２００４ | 羽衣出版 |
| 富山県の絶滅のおそれのある野生生物 レッドデータブックとやま２０１２ |
２０１２ | 富山県生活環境文化部 自然保護課 |
| 岐阜県の絶滅のおそれのある野生生物２００１ −岐阜県レッドデータブック− |
２００１ | 岐阜県公衆衛生 検査センター |
| 自然からのＳＯＳ！ レッドデータブックあいち・動物編解説 | ２００２ | 愛知みどりの会 |
| レッドデータブックあいち２００９「動物編」 | ２００９ | 愛知県環境部自然環境課 |
| レッドデータブックあいち２００９「植物編」 | ２００９ | 愛知県環境部自然環境課 |
| 絶滅のおそれのある愛知県の野生生物 ーレッドデータブックあいち２００９の概要ー |
２００９ | 愛知県環境部自然環境課 |
| ブルーデータブックあいち２０１２ | ２０１２ | 愛知県環境部自然環境課 |
| レッドデータブックあいち２０２０「動物編」 | ２０２０ | 愛知県環境部自然環境課 |
| レッドデータブックあいち２０２０「植物編」 | ２０２０ | 愛知県環境部自然環境課 |
| グリーンデータブックあいち２０１８ | ２０１８ | 愛知県環境部自然環境課 |
| 名古屋市の絶滅のおそれのある野生生物 レッドデータブックなごや２００４−動物編− |
２００４ | 名古屋市環境局 |
| 名古屋市の絶滅のおそれのある野生生物 レッドデータブックなごや２０１０−２００４年版補遺− |
２０１０ | 名古屋市環境局 |
| レッドデータブックなごや２０１５「動物編」 | ２０１５ | 名古屋市環境局 |
| レッドデータブックなごや２０１５「植物編」 | ２０１５ | 名古屋市環境局 |
| 自然のレッドデータブック・三重 三重県の保護上重要な地形・地質および野生生物 |
１９９５ | 三重県教育文化研究所 |
| 三重県レッドデータブック2015 〜三重県の絶滅のおそれのある野生生物 |
２０１５ | 共立印刷 |
| 滋賀県で大切にすべき野生生物 滋賀県レッドデータブック２００５年版 |
２００６ | サンライズ出版 |
| 奈良県版レッドデータブック［普及版］ 大切にしたい奈良県の野生動植物 |
２００９ | 奈良新聞社 |
| 京都府レッドデータブック ２００３［普及版］ | ２００３ | サンライズ出版 |
| 近畿地方の保護上重要な植物 −レッドデータブック近畿− | １９９５ | 関西自然保護機構 |
| レッドデータ ひょうごの野生動物 絶滅が心配されている動物たち |
１９９７ | 兵庫県自然保護協会 |
| 神戸版レッドデータ２０１０ 神戸の希少な野生動植物 |
２０１０ | 神戸市環境局環境創造部 |
| 改訂 しまねレッドデータブック 島根県の絶滅のおそれのある野生動植物 |
２００４ | 島根県 |
| しまねレッドデータブック【普及版】 島根県の絶滅のおそれのある野生動植物 |
２００５ | 山陰中央新報社 |
| 香川県レッドデータブック 香川県の希少野生生物 | ２００４ | 香川自然環境保全調査会 |
| 香川県レッドデータブック 香川県の希少野生生物【普及版】 |
２００４ | 香川県環境森林部 環境・水政策課 |
| ＲＥＤ ＤＡＴＡＢＯＯＫ ２００１ ながさきの希少な野生動植物【普及版】 | ２００１ | 長崎県自然保護協会 |